গণস্বাস্থ্য কেন্দ্রের প্রতিষ্ঠাতা জাফরুল্লাহ চৌধুরীর বিরুদ্ধে চাঁদাবাজির মামলা হয়েছে। জমি বিক্রিতে বাধ্য করার চেষ্টা এবং এক কোটি টাকা চাঁদা দাবির অভিযোগে এনে সোমবার রাতে আশুলিয়া থানায় মামলাটি দায়ের করেন মানিকগঞ্জের মোহাম্মদ আলী। এ মামলায় তিনি ছাড়াও আসামী করা হয়েছে আরো তিনজনকে। মামলার অপর আসামীরা হলেন, দেলোয়ার হোসেন, সাইফুল ইসলাম ও আওলাদ হোসেন। আশুলিয়া থানার ওসি রিজাউল হক এ তথ্য জানিয়েছেন। এ ব্যাপারে তদন্ত করে পরবর্তী ব্যবস্থা নেয়া হবে বলেও তিনি জানান।
এর আগে একটি বেসরকারি টেলিভিশনের টকশো আলোচনায় সেনাপ্রধান নিয়ে মন্তব্যের কারণে তার বিরুদ্ধে জিডি হয়। পরে সেটি রাষ্ট্রদ্রোহ মামলা হিসেবে গণ্য হয়।  
বাদি মামলার এজাহারে উল্লেখ করেছেন, পাথালিয়া মৌজার প্রায় চার একর ২৪ শতাংশ জমি তিনিসহ আরও দু’জন ২০০৩ সালে কিনেছিলেন। ওই জমি নেয়ার জন্য জাফরুল্লাহ ও তার  লোকজন তাকে নানাভাবে ‘ভয়ভীতি’ দেখিয়ে আসছিলো। তারা নাম মাত্র মূল্যে বিক্রির জন্য চাপ দেয়ার পাশাপাশি জীবননাশের হুমকি পর্যন্ত দেয়।
এজাহারে বলা হয়, গত ১৪ই অক্টোবর সকাল ১০টার দিকে তিনি ও তার সঙ্গী মো. আনিচুর রহমান জমি দেখতে যান। বেলা সাড়ে ১০টার দিকে তারা জমিতে থাকার অবস্থায় দেলোয়ার হোসেন, সাইফুল ইসলাম ও আওলাদ হোসেন ৩-৪ জন অজ্ঞাতনামা লোক তার জমিতে অবৈধভাবে প্রবেশ করে। তারা বলে, ডা. জাফরুল্লাহ চৌধুরীর নির্দেশ, ওই সম্পত্তি গণস্বাস্থ্য কেন্দ্রের কাছে হস্তান্তর না করলে ১ কোটি টাকা দিতে হবে। মামলার এজাহারে আরো বলা হয়, দাবিকৃত চাঁদা দিতে অস্বীকার করায় তারা জমিতে থাকা কাঁটাতারের বেষ্টনী, ৩টি লোহার সাইন বোর্ড এবং ১ টি গেট ভাঙচুর করে। যার আননুমানিক মূল্য ৫ট লাখ টাকা। প্রতিবাদ করলে খুনের হুমকি দেয়। একপর্যায়ে তারা ৩টি লোহার সাইন বোর্ড এবং ১ টি গেট নিয়ে যায়, যার মূল্য সাড়ে তিন লাখ টাকা।